Studijní oddělení zajišťuje veškerou agendu spojenou se studiem na 1. LF UK pro bakalářské, magisterské a navazující magisterské studijní programy, celoživotní vzdělávání v oblasti teoretických základů oborů a univerzitu třetího věku. 

Studijní oddělení ve vztahu k uchazečům, studentům a absolventům:

• komunikuje se zájemci o studium
• podílí se na organizaci Dne otevřených dveří a akcích jako je Jednička na zkoušku atd., sportovní soustředění pro 1.ročníky atd.
• administrativně zajišťuje přijímací řízení a odvolací řízení (organizaci přijímacích zkoušek a zpracování výsledků)
• zajišťuje zápisy do studia (přijatých uchazečů i stávajících posluchačů do vyšších ročníků)
• organizuje imatrikulace
• zajišťuje veškerou administrativu spojenou s průběhem studia ve vztahu k právním předpisům
• spolupracuje se státními úřady, kolejemi při ubytování studentů, cizineckou policií, Všeobecnou zdravotní pojišťovnou atd.
• vede matriku a zpracovává veškeré statistické údaje o studiu, připravuje podklady pro výroční zprávu fakulty týkající se pregraduálního studia
• vydává potvrzení a výpisy ze studijní evidence
• je kontaktním místem pro studenty se specifickými potřebami
• spolupracuje na organizaci státních závěrečných zkoušek
• organizuje promoce
• řídí agendu poplatků spojených se studiem
• spolupracuje při přípravě studijních plánů a podílí se na tvorbě rozvrhů pro daný akademický rok a jejich zadávání do elektronické databáze 

• koordinuje přípravu akreditací stávajících a nových studijních programů ve spolupráci s garanty a vedením fakulty
• komunikuje a řeší aktuální situace s fakultními instituty (ústavy, klinikami, učiteli apod.)
• zpracovává nostrifikace vysokoškolských diplomů
• aktualizuje informace týkající se agendy studijního oddělení na webových stránkách
• spolupracuje s domácími a zahraničními partnerskými institucemi (např. ECFMG, institucemi poskytujícími půjčky na studium, zahraničními zprostředkovateli atd.)