Nabídka doktorského studia v laboratoři nádorové biologie lymfomů, BIOCEV, 1. LF UK

Pracoviště: BIOCEV, Průmyslová 595, 252 50 Vestec (www.biocev.eu)

Laboratoř nádorové biologie lymfomů (https://havranek-lab.lf1.cuni.cz/about-us)

Vedoucí laboratoře: doc. MUDr. Ondřej Havránek, Ph.D.

Další školitelé: Mgr. Kristýna Kupcová, Ph.D. a doc. Anton Tkachenko, Ph.D.

Naše laboratoř se zaměřuje na základní výzkum nádorové biologie lymfomů (zhoubných nádorů vznikajících ve většině případů z B-lymfocytů). Máme rozsáhlé zkušenostmi nejen se základními technikami molekulární a buněčné biologie (mj. klonování, kultivace nádorových buněčných linií, pokročilá průtoková cytometrie, proteomika, genomika, metabolomika, in-vivo modely), ale také s dalšími specifickými mikroskopickými metodami (high resolution, TIRF, FLIM FRET), cílenou editací genomů, či s použitím biosenzorů na FRET (Förster resonance energy transfer) principu.

V rámci nové grantové podpory hledáme kandidáty se zájmem o studium nádorové biologie lymfomů, kteří se chtějí naučit široké spektrum moderních metod, základy bioinformatického zpracování dat, žádat o vlastní granty a publikovat v mezinárodních časopisech. Nabízíme témata základního i pre-klinického výzkumu.

Nabízená témata:

Molekulární mechanismy signalizace B-buněčného receptoru u EZB difúzního velkobuněčného B-lymfomu

- Hlavní náplní navrhovaného projektu je zjistit, jakými způsoby ovlivňují somatické genetické alterace signalizaci z B-buněčného receptoru u nejčastějšího typu lymfomu. Na základě literatury a předběžných dat existuje předpoklad, že tyto alterace ovlivňují dynamiku kortikálního aktinu a související signalizaci B-buněčného receptoru.

Multikombinační vertikální inhibice signální dráhy PI3K/AKT u B-buněčných lymfomů

- Navrhovaný disertační projekt je zaměřen na základní výzkum molekulárních mechanizmů multikombinační vertikální inhibice signální dráhy PI3K/AKT u B-buněčných lymfomů. Projekt navazuje na předchozí výsledky naší výzkumné skupiny, které ukázaly, že současné zacílení na více regulačních úrovní PI3K/AKT dráhy vede ke stabilnější inhibici signalizace než inhibice jednotlivých molekul vybrané signální dráhy.

Léčba lymfomů pomocí organoidních modelů bez použití chemoterapeutik

- Navrhovaný projekt si klade za cíl vyvinout inovativní chemo-free terapeutické strategie prostřednictvím organoidních in-vitro modelů, které věrně napodobují složité interakce mezi nádorovými buňkami a jejich mikroprostředím. Tyto interakce není možné dopodrobna prozkoumat v konvenčních 2D buněčných modelech, což významně omezuje současné porozumění molekulárním mechanismům lymfomogeneze a terapeutické rezistenci.

Vývoj nových přístupů k hodnocení toxicity nanomateriálů a nano-bio interakcí se zaměřením na regulované formy buněčné smrti

- Nanotechnologie je rychle se rozvíjející obor s potenciálem v protinádorové léčbě. Cílem projektu je vypracovat nové přístupy k hodnocení toxicity nanomateriálů a nano-bio interakcí na základě identifikace jejich schopnosti vyvolat různé formy regulované buněčné smrti (apoptóza, erytróza, nekróza, ferropóza, pyropóza atd.) s následným testováním terapeutické využitelnosti nejslibnějších nanomateriálů.

Nabízíme práci v přátelském prostředí dynamické skupiny se zavedenou zahraniční spoluprací, která působí v moderním vědeckém centru s prvotřídním výzkumným zázemím. V rámci studia je možné absolvovat 6-12 měsíční zahraniční stáž.

Plně finančně zajištěné pozice jsou otevřené s předpokládaným nástupem v akademickém roce 2026/2027.

Podrobnější informace ohledně naší laboratoře (včetně publikační aktivity) je možné nalézt na stránkách: https://havranek-lab.lf1.cuni.cz/about-us

Kontakt:

V případě zájmu zašlete životopis a krátké shrnutí, proč by vás práce v naší skupině zajímala, na e-mail: ondrej.havranek@lf1.cuni.cz