Potřebujete pomoc nebo informace a nevíte přesně na koho se obrátit?
Kontaktujte násKurz Klinická informatika a bioinformatika 2023 – B90277
Oborová rada Ph.D. Biomedicínská informatika
Termín: 12.6.- 15.6 2023 (pondělí až čtvrtek) 8- 16 (17) hod. s přestávkou v poledne
Vhodný pro studenty všech OR
Pondělí 12.6.2023
Místo konání : U Nemocnice 2, 1. patro, seminární místnost 3. interní kliniky, budova A10
1. Svačina
Š. : Úvod do biomedicínské informatiky 8-9 hod.
2. Kasal
P.: Hodnocení kvality zdravotnické informace
9-12 h
3. Lhotská
L.: Systémy pro podporu rozhodování 13-15
hod
4. Šoupal
J.: Technologie v diabetologii 15-17
Úterý 13.6.2023
Místo konání: Klinika
pediatrie a dědičných metabolických poruch, Ke Karlovu 2, seminární místnost
3.patro
Přenášky jsou plánovány na cca 40 minut+5 minut diskuse+15 minut přestávka
5. Teoretické
základy bioinformatiky
i.
9.00-9.45 Jan Pačes; Úvod do bioinformatiky
ii.
10.00-10.45 Petr Daněček; datové formáty, kontrola kvality, porovnávání
sekvencí; alignement)
iii.11.00-11.45 Marian Novotný; Alphafold a predikce 3D struktur
oběd
iv. 13.00-13.45 Vladimír Hampl; fylogenetické stromy
v. 14.00-14.45 Anna Přistoupilová; Principy a aplikace metod sekvenování nové
generace
vi.15.00-15.45 Aleš Hnizda; strukturní analýza
Přednáška
SVV a UNCE
vii.
16.00-17.00 Pavel Doležal; Biogeneze a funkce mitosomů, nejmenších známých
mitochondrií.
Středa 14.6.2023
Místo konání: Klinika pediatrie a dědičných metabolických poruch, Ke Karlovu 2, seminární místnost 3.patro
Přenášky jsou plánovány na cca 40 minut+5 minut diskuse+15 minut přestávka
6. Biomedicínské
aplikace
I.
9.00-9.45 Radek Šindelka; Analýza genové exprese
II. 10.00-10.45 Marek Vrbacký; Funkční anotace -OMICs dat
III. 11.00-11.45 Jaroslav Hrabák; Metagenomika,
oběd
IV. 13.00-13.45 Tomáš Čajka; Metabolomika: od přípravy vzorků po analýzu dat
V. 14.00-14.45 Petr Novák; Analýza proteomu a návrh cílených experimentů
VI. 15.00-15.45 Jiří Vondrášek; ELIXIR
VII.
16.00-17.00 Diskuse
Čtvrtek 15.6.2023
Místo konání : U Nemocnice 2, 1. patro, seminární místnost 3. interní kliniky, budova A10
7. Dušek L.,
Blaha M.: Národní zdravotnický informační systém jako základna eHealth
v moderním zdravotnictví 8-9.30
8. Blaha M.,
Dušek L.: Koncepce a hlavní komponenty
moderního elektronického zdravotnictví
9.30-11
9. Zvára K –
Informační systémy ve zdravotnictví 11-12-30
hod
10. Zitová
B.: analýza obrazu v medicíně 13-15
11. Bruthans J.
E- recept u nás a ve světě 15-16.45
hod
12. Svačina Š.: Závěrečná
diskuse a zápočet
V bioinformatice
témata- analýza genomu, molekulárně biologické databáze, principy alignmentu,
predikce genů, evoluční stromy, analýza vlastnosti proteinů, geometrická
analýza 3D struktur, protein folding, molekulární docking, statisticky aparát
bioinformatiky.
Zájemci se mohou hlásit přímo panu prof. MUDr. Štěpánovi Svačinovi, DrSc.
na email: stepan.svacina@lf1.cuni.cz